Побічні ефекти прийому міноксидилу внутрішньо як антигіпертензивний препарат можуть включати набряк обличчя та кінцівок, часте та нерегулярне серцебиття, запаморочення, ураження серця, та вогнищевий некроз папілярних м'язів серця.
У поодиноких випадках ці ліки можуть всмоктуватися через шкіру і викликати серйозніші побічні ефекти, у тому числі: випадання волосся на обличчі/тілі, запаморочення, швидке серцебиття, непритомність, біль у грудях, набряк рук або ніг, незвичайне збільшення ваги, втома, утруднене дихання, особливо у лежачому положенні.
засіб надає спрямований вплив на кровоносні судини і тому не торкається ніяких компонентів чоловічої статевої системи.
Для розвитку ефекту препарат потребує безперервного призначення протягом кількох місяців: від 3-4 місяців до 1 року. Для підтримки ефекту препарат вимагає постійного застосування, при відміні поступово розвивається синдром відміни, волосся випаде у великій кількості.