Існують три основні види електронних мікроскопів Звичайний просвічувальний електронний мікроскоп (з’явився в 1930-х роках), растровий (скануючий) електронний мікроскоп (1950-ті роки), растровий тунельний мікроскоп (1980-ті роки) .14 Mar 2017
Поділяється на кілька видів: оптична мікроскопія, електронна мікроскопія, багатофотонна мікроскопія, рентгенівська мікроскопія, рентгенівська лазерна мікроскопія і призначається для спостереження і реєстрації збільшених зображень зразка.
В оптичному мікроскопі ступінь збільшення визначається шляхом множення збільшення об’єктива на збільшення окуляра. Оскільки цифровий мікроскоп не має окуляра, ступінь збільшення визначається за тим, у скільки разів досліджуваний зразок збільшується при відтворенні на моніторі.
Цифрова мікроскопія дає змогу виконувати глибший аналіз збільшеного зображення, наприклад, вимірювання відстаней і площ. Цифрові USB-мікроскопи малої потужності, спрощено являють собою web-камери, що підключаються до комп’ютера через USB-порт.