Вміст флакона розчинити кип'яченою водою кімнатної температури з розрахунку 5 мл (чайна ложка) води на 1 дозу препарату.
Дорослим та дітям старше 12 років препарат рекомендується приймати по 5 доз 2-3 десь у день. Тривалість курсу лікування визначається тяжкістю клінічної картини, результатами бактеріологічних та інших досліджень, віком хворого та становить 2-4 тижні, а в окремих випадках до 3-х місяців.
Дітям старше 3-х років та дорослим при гострих та хронічних запальних захворюваннях тонкого та товстого кишечника (ентероколітах та колітах) рекомендується приймати по 1 капсулі (5 доз) 2-3 рази на день. У тяжких випадках захворювання доза може бути подвоєна.
Порошок можна змішати з 30-50 мл кип'яченої води кімнатної температури, при цьому утворюється каламутна завись з частинками сорбенту чорного кольору. Отриману водну завись слід випити, не добиваючись повного розчинення. Залежно від тяжкості захворювань Біфідумбактерін форте застосовують у звичайних чи збільшених дозах.